Можно запустить добавление в избранное для IE разными способами, НО вы не сможете произвести добавление незаметно для пользователя. Итак, можно самым простым и честным: ссылка "Добавить в избранное". Можно даже при наведении на эту ссылку. Ещё один способ - автоматически при загрузке страницы или при покидании сайта. В любом случае скрипт будет не сильно видоизменяться.